都是国际标准化组织，TS16949主要针对汽车领域，ISO9000对企业主要有两种作用,1.是建立企业内部质量体系的一个纲领和基准 2.作为内部考核体系有效性的指导依据 。

TS16949是 国际汽车行业的技术规范，是基于ISO9001的基础，加进了汽车行 
业的技术规范。此规范完全和ISO9000:2008保持一致，但更着重于缺陷防范、减少在汽车零部件供应链中容易产生的质量波动和浪费。 
TS16949是 国际汽车行业的一个技术规范，其针对性和适用性非常明确：此规范只适用于汽车整车厂和其直接的零备件制造商。这些厂家必须是直接与生产汽车有关的，能开展加工制造活动，并通过这种活动使产品能够增值。对所认证的公司厂家资格，有着严格的限定。那些只具备支持功能的单位，如设计中心，公司总部和配送中心等，不能独立获得TS16949：2002的认证。对那些为整车厂家或汽车零备件厂家制造设备和工具的厂家，也不能获得TS16949：2002的认证。因此，TS16949:2002的实施，对 三大汽车公司和他们的零备件制造供应商将有直接的影响。 
TS16949特别注重厂家的完成品及实现这个完成品的质量系统能力。它认为这是整个制造过程活动的基础。另一个特点是，它特别注重一个机构的质量管理系统的有效性。 
TS16949：2002的审核，由从单一的要素的审核转变成一个过程的审核。一个过程的审核将把重点放在以用户为中心。它是根据用户的要求来评估厂家的活动，围绕用户的满意度来衡量厂家的表现。另外，三大汽车制造商，对其供应商都提出了产品的特别要求，而 TS16949：2002的审核，也包括了对满足这些要求的过程审核。 
TS16949把用户的要求和技术规范放在同等重要的位置。因此，认证公司对厂家的认证审核，很多地方类似于第二方的审核。 
TS16949：2002的主要特点之一是，它是受IATF承认的一个单一的全球质量系统标准和注册程序。互相承认 将减少第二方和第三方的审核，为厂家节省费用。另外，相对于文件审核，TS16949更注重过程的审核。 
由于 TS16949：2002已包含了ISO9001：2008的所有内容，所以获得TS16949：2002的认证，也标志着符合ISO9001：2008标准。